超滤膜系统设备主要应用在以下领域：
电泳超滤：超滤装置是电泳涂装线中主要设备之一，其作用是节约电泳涂料，使其利用率到95%以上，减少污水处理量及费用，通过超滤液的排放可以有效的控制电泳槽内槽液的电导率及杂质离子的含量，保证电泳涂膜的质量。经过多年的实践证明，卷式超滤装置以其性能稳定，经济适用等优点，目前被广泛的应用到电泳涂装线上。
酶制剂的浓缩纯化：有些酶对温度敏感，不能用真空浓缩（因为是蒸汽蒸发），超滤可以在常温、低温下进行。在超滤过程中，可以根据我们需要的物料分子量选择合适孔径的膜，使得我们不需要的小分子物质在透过液中去除，所以浓缩后的产品纯度好，外观好，另外，酶的回收率提高了2-3倍，相比传统浓缩工艺，节约能源约50% 。

乳制品加工及分离：超滤膜截留大部分乳蛋白，实现蛋白质与乳糖、矿物质、盐和水的分离，可把蛋白质浓度由10%--12%增加到50%甚至80%，制作乳清蛋白浓缩物，继而生产乳清蛋白粉，比传统蒸发工艺大大节省了能耗。超滤膜主要用于乳清蛋白和乳清分离蛋白浓缩、全牛奶蛋白浓缩、 奶酪制备中的浓度控制。